Для проведення процедури державної перереєстрації готового лікарського засобу до Центру подається три примірники реєстраційного досьє для проведення експертизи щодо безпеки лікарського засобу; експертизи інструкцій та номенклатури; експертизи щодо ефективності лікарського засобу. За узгодженням з Центром окремі частини реєстраційного досьє можуть подаватися в електронному вигляді.
Для традиційних лікарських засобів, гомеопатичних лікарських засобів, що відповідають вимогам Додатку 7 до Порядку проведення експертизи реєстраційних матеріалів, затвердженого наказом МОЗ від 23.07.2015 № 460, та лікарських засобів, які відносяться до групи «Медичні гази» – два примірники реєстраційного досьє для проведення експертизи щодо безпеки лікарського засобу; експертизи інструкцій та номенклатури.
Для лікарських засобів, що виробляються згідно з затвердженими прописами, надається один примірник реєстраційного досьє для проведення експертизи інструкцій та номенклатури.